לאחר החלטת 'כ"ט בנובמבר' נקראו חברי הפלי"ם לתרום את חלקם בלחימה היבשתית נגד הפלשתינים בתקופה הקשה ביותר בחודשי מרץ-מאי 1948:

- כ-200 ימאים צורפו במסגרת הגדוד הרביעי לכוח 'נחשון', שפעל להסרת המצור מעל ירושלים (70 מהם נהרגו בקרבות אלו). בהפוגה הראשונה הצטרפו רבים מהם לחבריהם, שבאותה עת הקימו את 'השירות הימי' (לימים חיל הים), לאחר שמסגרת הפלי"ם נותקה מהפלמ"ח.

- פלוגת נמל חיפה השתלבה בלחימת חטיבת כרמלי לכיבוש העיר התחתית. לאחר מכן שולבו חבריה בבסיס נמל חיפה שהוקם ע"י 'השירות הימי'.

מאגר המלווים של הפלי"ם, המשיך לשרת במהלך מלחמת העצמאות את אוניות העולים והרכש בכפיפות ל'מוסד לעליה' ומערכת הרכש. חברים אלו נותרו "יתומים" מאב ואם, מחיל הים, כ"יורש" הפלי"ם, מחד ומהגדוד הרביעי, שצורף לחטיבת הראל ונקרא גדוד 'הפורצים', מאידך. חלק מהם הצטרפו על בסיס אישי לחטיבות הפלמ"ח השונות (קבוצה של 8 חברים הצטרפה לגדוד ה-9 בחטיבת הנגב).